San Francisco is een gemeente in het Colombiaanse departement Putumayo. De gemeente telt 5270 inwoners (2005). De rivieren San Francisco en Putumayo stromen door de gemeente, waarvan het westelijke deel gelegen is op de oostelijke uitlopers van de Cordillera Central.
Economische activiteit De belangrijkste economische sectoren van San Francisco zijn de veeteelt, mijnbouw (ongebluste kalk, marmer en goud) en landbouw (bonen, erwten, maïs, munt en lulo).
Categorie:Gemeente in Putumayo