De Intertoto Cup was sinds 1967 een mogelijkheid voor ploegen om in de zomer te kunnen blijven voetballen. Deze editie van 1988 werd zoals gebruikelijk gehouden tijdens deze zomerstop. Er werden alleen groepswedstrijden georganiseerd, omdat het onhaalbaar bleek om nog knock-outronden te spelen na de zomerstop. Clubs hadden daarvoor een te druk programma en de UEFA had bepaald dat ploegen die al aan UEFA-toernooien zoals de twee edities van de Europa Cup meededen, niet mochten deelnemen aan andere toernooien.
Aan deze editie van het toernooi deden 44 ploegen mee, twaalf meer dan vorig jaar. Er waren elf groepen van vier teams en elk team speelde zes wedstrijden. Er deden vijf ploegen mee uit Denemarken, Oostenrijk en Zweden; vier uit Hongarije, Oost-Duitsland, Tsjecho-Slowakije, West-Duitsland en Zwitserland; twee uit Israël, Nederland, Polen en de SFR Joegoslavië en één uit Bulgarije.
Het Deense Ikast FS uit groep 7 haalde dit toernooi de hoogste score: elf punten en een doelsaldo van +18.
Eindstanden Groep 1 plaats ClubDoelpuntenPunten 1. Malmö FF 11 : 4 9 2. 20px|Oost-Duitsland Karl-Marx-Stadt 8 : 7 8 3. 20px|West-Duitsland Hannover 96 10 : 9 4 4. FC Den Haag 7 : 16 3
Groep 2 plaats ClubDoelpuntenPunten 1. IFK Göteborg 10 : 7 8 2. Sigma Olomouc 10 : 10 7 3. Slavia Sofia 8 : 9 5 4. FC Aarau 7 : 9 4
Groep 3 plaats ClubDoelpuntenPunten 1. Banik Ostrava 12 : 11 8 2. Örgryte IS 13 : 9 7 3. Brondby IF 10 : 10 6 4. 20px|Oost-Duitsland Chemie Halle 5 : 10 3
Groep 4 plaats ClubDoelpuntenPunten 1. Vienna 11 : 14 7 2. TJ Rudá Hvězda Cheb 11 : 7 6 3. Vejle BK 6 : 6 6 4. 20px|Hongarije Banyasz Tatabánya 7 : 8 5
Groep 5 plaats ClubDoelpuntenPunten 1. BSC Young Boys Bern 16 : 9 8 2. DAC Dunajska Streda 12 : 8 7 3. IFK Norrköping 8 : 13 5 4. 20px|Hongarije Szombathelyi Haladás 6 : 12 4
Groep 6 plaats ClubDoelpuntenPunten 1. 20px|West-Duitsland FC Kaiserslautern 15 : 8 9 2. Admira Wacker 12 : 7 7 3. FC Luzern 11 : 10 7 4. ŁKS Łódź 9 : 22 1
Groep 7 plaats ClubDoelpuntenPunten 1. Ikast FS 20 : 2 11 2. Sturm Graz 13 : 10 7 3. Beitar Jeruzalem 8 : 16 4 4. Sjimsjon Tel Aviv 3 : 16 2
Groep 8 plaats ClubDoelpuntenPunten 1. 20px|Oost-Duitsland FC Carl Zeiss Jena 8 : 11 7 2. 20px|Joegoslavië Rad Beograd 11 : 7 6 3. Aarhus GF 10 : 9 6 4. Tirol Innsbruck 10 : 12 5
Groep 9 plaats ClubDoelpuntenPunten 1. Grasshopper-Club 8 : 2 10 2. 20px|Hongarije Pécsi MSC 6 : 6 5 3. Pogon Szczecin 3 : 4 5 4. Östers IF 5 : 10 4
Groep 10 plaats ClubDoelpuntenPunten 1. 20px|West-Duitsland Karlsruher SC 13 : 7 7 2. 20px|Joegoslavië Vojvodina Novi Sad 11 : 7 7 3. 20px|Hongarije MTK Boedapest 5 : 9 6 4. Grazer AK 5 : 11 4
Groep 11 plaats ClubDoelpuntenPunten 1. 20px|West-Duitsland Bayer Uerdingen 11 : 4 11 2. OB Odense 16 : 10 7 3. 20px|Oost-Duitsland FC Magdeburg 9 : 15 4 4. AZ'67 10 : 17 2
Zie ook Europacup I 1988/89 Europacup II 1988/89 UEFA Cup 1988/89 voor alle uitslagen, door Pawel Mogielnicki (RSSSF)
Categorie:Intertoto Cup Categorie:Europacupvoetbal 1988/89