Het seizoen 2005-2006 was het 41e jaar in het bestaan van de Enschedese voetbalclub FC Twente. De Tukkers kwamen uit in de Nederlandse Eredivisie en namen deel aan het toernooi om de KNVB beker.

De ploeg FC Twente stond dit jaar voor het tweede seizoen onder leiding van trainer Rini Coolen. De zesde plaats die in het seizoen 2004/05 was behaald, kwam echter geen moment in het zicht. Op 1 februari 2006 besloot Coolen vanwege de teleurstellende resultaten en onenigheid met voorzitter Joop Munsterman over de te volgen koers op te stappen. Hij werd voor de rest van het seizoen opgevolgd door zijn assistent Jan van Staa. Ook technisch directeur Johan Plageman maakte in maart bekend Twente te gaan verlaten. Hij bleef in tegenstelling tot Coolen wel tot het eind van het seizoen in functie.

De Deen Kim Christensen (naar Brøndby IF) en de van Schalke 04 gehuurde Duitser Simon Cziommer hadden Twente verlaten. Eind september 2005 vertrok tevens Jason Čulina naar PSV. Raymond Fafiani werd verhuurd aan FC Zwolle. In de winterstop werd verdediger Daniel Majstorović getransfereerd naar FC Basel.

De Zweed Kennedy Bakırcıoğlu kwam in de zomer van 2005 over van Iraklis Saloniki. Uit de eigen jeugd kregen Wout Brama, Patrick Gerritsen en Marcel Kleizen de kans om zich in het eerste te bewijzen. Doelman Danny Wintjens werd van MVV aangetrokken. De Griek Konstantinos Loumpoutis werd gekocht van Perugia. In januari 2006 werden Arnar Viðarsson bij SC Lokeren en Anatoli Gerk bij RSC Anderlecht weggehaald.

Het seizoen Het seizoen 2005-2006 begon rampzalig met drie thuisnederlagen tegen N.E.C., Vitesse en Feyenoord. Na zes wedstrijden stond Twente op een zestiende plek, met vier punten. Hierna ging het iets beter en na tien wedstrijden stond Twente onder andere door overwinningen op Heracles Almelo en RKC Waalwijk op een veertiende plek. De thuiswedstrijden tegen PSV en AZ gingen verloren en uit wist Twente maar een enkel keer een punt te pakken, onder andere uit tegen PSV op 29 december 2005 (1-1). De wedstrijd thuis tegen Ajax op 22 januari ging verloren ondanks dat Twente tot de 89e minuut met 2-1 leidde. Een week later werd verloren bij Sparta, wat voor trainer Rini Coolen het sein was om op te stappen. Twente stond op dat moment dertiende, één plaats onder streekgenoot Heracles.

Coolen werd opgevolgd door zijn assistent Jan van Staa die het seizoen als interim-coach mocht afmaken. Die wissel was zo succesvol dat al snel van een "Van Staa-effect" werd gesproken; in een reeks van acht wedstrijden werd zes keer gewonnen en twee keer gelijk gespeeld. Twente steeg hierdoor naar een achtste plek en was nadrukkelijk in de race voor deelname aan de play-offs voor een UEFA-Cup-ticket. De negende plaats waarmee de reguliere competitie beëindigd werd, gaf daar uiteindelijk recht op. Twente versloeg in de eerste ronde van de play-offs FC Utrecht, dat als zesde was geëindigd. sc Heerenveen kreeg echter de plek in de UEFA Cup, nadat het in de tweede play-offs-ronde in Enschede Twente met 1-0 versloeg en thuis met 5-0 de betere was. Voor FC Twente restte, nadat in de derde play-offs-ronde Vitesse werd uitgeschakeld, de Intertoto.

In het toernooi om de KNVB beker 2005/06 reikte FC Twente tot de achtste finales. Quick Boys (na verlenging), Fortuna Sittard en RKC Waalwijk (na verlenging) werden uitgeschakeld, waarna PSV op 20 december 2005 met 3-0 te sterk was. In de laatste wedstrijd werden twee doelpunten gescoord door oud-Twentespeler Jan Vennegoor of Hesselink. Twente speelde in de bekercompetitie enkel uitwedstrijden.

Topscorer in de reguliere competitie werd Blaise Nkufo, met twaalf doelpunten. De grootste overwinning was 4-0, in een uitwedstrijd tegen Heracles. De grootste nederlaag was 5-0 in de play-offs tegen Heerenveen. De ploeg haalde in de competitie dertien overwinningen, dertien nederlagen en acht gelijke spelen, waarmee het op 47 punten uitkwam.

Wedstrijdstatistieken Eredivisie 2005/06 13 augustus 2005 Roda JC 2 - 0 (1 - 0) FC Twente Opstelling FC Twente: Parkstad Limburg Stadion12.700 toeschouwersKevin Blom Edrissa Sonko 33'Arouna Koné 80' Pasveer, Schuurman (76' Brama), Majstorović 10px|Aanvoerder, Zomer, Loumpoutis, Niemeyer, Čulina, Heubach, Touma, Nkufo, Gakhokidze (60' Bakırcıoğlu) 10px Majstorovic (38') Wout Brama, afkomstig uit de jeugd van FC Twente, maakte met een invalbeurt zijn debuut in de Eredivisie. 20 augustus 2005 FC Twente 0 - 1 (0 - 0) N.E.C. Opstelling FC Twente: Arke Stadion13.000 toeschouwersJan Wegereef 81' Tininho Pasveer, Schuurman (84' Shoukov), Majstorović 10px|Aanvoerder, Zomer, Heubach, Niemeyer, Brama, Čulina, Bakırcıoğlu (46' Gakhokidze), Nkufo, Touma 10px Zomer (90') 28 augustus 2005 FC Utrecht 1 - 3 (0 - 1) FC Twente Opstelling FC Twente: Stadion Galgenwaard17.100 toeschouwersJack van Hulten Hans Somers 89' 34' Jason Čulina73' Blaise Nkufo90' Sharbel Touma Pasveer, Wellenberg (84' Rahim), Majstorović 10px|Aanvoerder, Zomer, Heubach, Niemeyer, Čulina, Shoukov (56' Gakhokidze), Bakırcıoğlu (46' Brama), Nkufo, Touma 10px Niemeyer (30'), Majstorović (47'), Gakhokidze (83') 11 september 2005 FC Twente 0 - 1 (0 - 0) Vitesse Opstelling FC Twente: Arke Stadion13.000 toeschouwersPieter Vink 90' Matthew Amoah Pasveer, Schuurman, Majstorović 10px|Aanvoerder, Zomer, Heubach (46' Loumpoutis), Brama, Shoukov (62' Niemeyer), Čulina, Touma, Nkufo, Gakhokidze (75' El Ahmadi) 16 september 2005 ADO Den Haag 0 - 0 (0 - 0) FC Twente Opstelling FC Twente: Zuiderpark Stadion5.613 toeschouwersTom van Sichem Pasveer, Rahim, Majstorović 10px|Aanvoerder, Zomer, Loumpoutis, Niemeyer, Shoukov, Čulina, Touma (63' Afonso), Nkufo, Gakhokidze (75' Brama) 10px Majstorović (6'), Loumpoutis (52'), Niemeyer (90') 25 september 2005 FC Twente 1 - 3 (0 - 1) Feyenoord Opstelling FC Twente: Arke Stadion13.250 toeschouwersRoelof Luinge Ramon Zomer 84' 26' Romeo Castelen46' Romeo Castelen89' Dirk Kuijt Pasveer, Rahim, Majstorović 10px|Aanvoerder, Zomer, Loumpoutis, Brama, Shoukov (62' Sibum), Čulina, El Ahmadi (53' Afonso), Nkufo, Touma (76' Bakırcıoğlu) Jason Čulina speelde zijn laatste wedstrijd voor FC Twente. Op 30 september 2005 tekende hij een contract bij PSV. 2 oktober 2005 Heracles Almelo 0 - 4 (0 - 0) FC Twente Opstelling FC Twente: Polman Stadion8.500 toeschouwersDick van Egmond 54' Daniel Majstorović60' Kennedy Bakırcıoğlu83' Ramon Zomer90' Blaise Nkufo Boschker 10px|Aanvoerder, Rahim, Majstorović, Zomer, Loumpoutis, Sibum, Brama, El Ahmadi (46' Bakırcıoğlu), Afonso (87' Kleizen), Nkufo, Touma (90' Gerritsen) 10px Zomer (32'), El Ahmadi (46') Jeugdspelers Patrick Gerritsen en Marcel Kleizen maakten met een invalbeurt hun debuut in het eerste elftal van FC Twente. Keeper en aanvoerder Sander Boschker maakte zijn rentree na een in de voorbereiding op het seizoen opgelopen blessure. 15 oktober 2005 FC Twente 2 - 0 (1 - 0) RKC Waalwijk Opstelling FC Twente: Arke Stadion13.000 toeschouwersReinold Wiedemeijer Kennedy Bakırcıoğlu 35'Kennedy Bakırcıoğlu 67' Boschker 10px|Aanvoerder, Rahim, Majstorović, Zomer, Heubach, Sibum, Brama (85' Niemeyer), Shoukov, Bakırcıoğlu (90' Kleizen), Nkufo, Touma (69' Afonso) 10px Heubach (33') 22 oktober 2005 NAC Breda 1 - 1 (0 - 0) FC Twente Opstelling FC Twente: MyCom Stadion14.150 toeschouwersJack van Hulten Johan Vonlanthen 61' 73' Peter Niemeyer Boschker 10px|Aanvoerder, Rahim, Majstorović, Zomer, Heubach, Brama (46' Niemeyer), Sibum, Bakırcıoğlu, Touma, Nkufo, Shoukov 10px Heubach (5'), Rahim (77') 29 oktober 2005 FC Twente 0 - 1 (0 - 0) PSV Opstelling FC Twente: Arke Stadion13.100 toeschouwersRuud Bossen 70' Ibrahim Afellay Boschker 10px|Aanvoerder, Rahim, Majstorović, Zomer, Heubach, Sibum (46' Brama), Niemeyer, Shoukov (77' Kleizen), Bakırcıoğlu, Nkufo, Touma (77' Afonso) 10px Rahim (69') 5 november 2005 FC Twente 3 - 1 (0 - 0) Willem II Opstelling FC Twente: Arke Stadion13.000 toeschouwersBen Haverkort Guilherme Afonso 46'Blaise Nkufo 56'Blaise Nkufo (p) 81' 69' Kevin Bobson Boschker 10px|Aanvoerder, Rahim, Majstorović, Zomer, Heubach, Niemeyer, Brama (83' Sibum), Bakırcıoğlu, El Ahmadi (59' Gerritsen), Nkufo, Afonso (55' Shoukov) 10px Brama (49') 19 november 2005 AFC Ajax 2 - 0 (0 - 0) FC Twente Opstelling FC Twente: Amsterdam ArenA45.120 toeschouwersReinold Wiedemeijer Daniel Majstorović (ed) 70'Markus Rosenberg 90' Boschker 10px|Aanvoerder, Rahim, Majstorović, Zomer, Heubach, Niemeyer, Brama, El Ahmadi, Bakırcıoğlu (68' Afonso), Nkufo, Touma 10px Niemeyer (36'), Boschker (76') 30 november 2005 FC Twente 1 - 0 (0 - 0) Sparta Opstelling FC Twente: Arke Stadion13.000 toeschouwersRené Temmink Patrick Gerritsen 90' Boschker 10px|Aanvoerder, Rahim, Majstorović, Zomer, Heubach, Niemeyer, Brama (79' Sibum), Bakırcıoğlu, Afonso (60' Gakhokidze), Nkufo, Touma (73' Gerritsen) De wedstrijd stond aanvankelijk gepland op 26 november, maar werd op die datum afgelast wegens sneeuwval. 4 december 2005 FC Groningen 1 - 0 (0 - 0) FC Twente Opstelling FC Twente: Euroborg12.500 toeschouwersDick van Egmond Yuri Cornelisse 71' Boschker 10px|Aanvoerder, Rahim, Majstorović, Zomer, Heubach (80' Gerritsen), Sibum, Niemeyer, Bakırcıoğlu (75' Gakhokidze), Afonso, Nkufo, Touma 10px Sibum (15'), Zomer (28') 10px Nkufo (19') Blaise Nkufo kreeg een rode kaart voor een trappende beweging naar tegenstander Evgeniy Levchenko en werd voor twee wedstrijden geschorst. 10 december 2005 FC Twente 1 - 3 (1 - 0) AZ Opstelling FC Twente: Arke Stadion13.100 toeschouwersKevin Blom Kennedy Bakırcıoğlu 32' 65' Stein Huysegems71' Danny Koevermans90' Denny Landzaat Boschker 10px|Aanvoerder, Schuurman, Majstorović, Zomer, Heubach, Brama, Shoukov (78' Loumpoutis), Bakırcıoğlu, Touma (70' Gerritsen), Afonso, Gakhokidze 10px Heubach (60'), Gakhokidze (74') 17 december 2005 sc Heerenveen 3 - 1 (2 - 0) FC Twente Opstelling FC Twente: Abe Lenstra Stadion20.500 toeschouwersJan Wegereef Klaas-Jan Huntelaar 13'Lasse Nilsson 41'Klaas-Jan Huntelaar 49' 77' Patrick Gerritsen Boschker 10px|Aanvoerder, Schuurman (72' Sibum), Majstorović, Zomer, Loumpoutis, Niemeyer, Brama, Bakırcıoğlu, Gerritsen, Gakhokidze, Touma (59' Afonso) 10px Loumpoutis (20') 26 december 2005 FC Twente 4 - 1 (2 - 0) RBC Roosendaal Opstelling FC Twente: Arke Stadion12.250 toeschouwersReinold Wiedemeijer Peter Niemeyer 23'Ramon Zomer 25'Ramon Zomer 53'Daniel Majstorović 73' 64' Ebrima Sillah Boschker 10px|Aanvoerder, Schuurman, Majstorović, Zomer, Heubach, Sibum (89' Loumpoutis), Niemeyer, Bakırcıoğlu, Gerritsen (80' Touma), Nkufo, Gakhokidze 10px Heubach (56') Halverwege de competitie stond FC Twente op een twaalfde plaats, met 20 punten uit 17 wedstrijden. 29 december 2005 PSV 1 - 1 (0 - 1) FC Twente Opstelling FC Twente: Philips Stadion32.500 toeschouwersDick Jol Phillip Cocu 69' 40' Kennedy Bakırcıoğlu Boschker 10px|Aanvoerder, Rahim, Majstorović, Zomer, Heubach, Sibum (75' Brama), Bakırcıoğlu (90' Bouchiba), Niemeyer, Gerritsen (86' Afonso), Nkufo, Gakhokidze 10px Gakhokidze (50'), Rahim (63') 15 januari 2006 Willem II 1 - 1 (1 - 0) FC Twente Opstelling FC Twente: Willem II Stadion12.000 toeschouwersKevin Blom Anouar Hadouir 8' 57' Blaise Nkufo (p) Boschker 10px|Aanvoerder, Rahim (72' Schuurman), Majstorović, Zomer, Heubach, Bakırcıoğlu, Niemeyer, Shoukov (77' Sibum), Gerritsen (64' Afonso), Nkufo, Gakhokidze 10px Rahim (27'), Majstorović (72'), Schuurman (74') Daniel Majstorović speelde zijn laatste wedstrijd voor FC Twente. Voor de volgende wedstrijd was hij geschorst en een week later werd zijn overgang naar het Zwitserse FC Basel beklonken. 22 januari 2006 FC Twente 2 - 3 (1 - 0) AFC Ajax Opstelling FC Twente: Arke Stadion13.250 toeschouwersJan Wegereef Blaise Nkufo 25'Blaise Nkufo 52' 51' Markus Rosenberg89' Hedwiges Maduro90' Urby Emanuelson Boschker 10px|Aanvoerder, Schuurman, Niemeyer, Zomer, Heubach, Viðarsson, Bakırcıoğlu (74' Brama), Gerk (68' Shoukov), Gerritsen (87' Touzani), Nkufo, Gakhokidze