Dit artikel bevat een lijst van vlaggen van Indonesische gemeenten. In januari 2023 waren er 514 administratieve afdelingen van het tweede niveau (416 regentschappen en 98 steden) in Indonesië. De onderstaande lijst groepeert regentschappen en steden in Indonesië per provincie. Elk regentschap heeft een administratief centrum, de regentschapszetel. De onderstaande lijst groepeert regentschappen en steden in Indonesië per provincie.
Atjeh
Bali
Bangka-Belitung
Banten
Bengkulu
Gorontalo
Jakarta
Jambi
Lampung
Midden-Java
Midden-Kalimantan
Midden-Sulawesi
Molukken
Noord-Kalimantan
Noord-Molukken
Noord-Sulawesi
Noord-Sumatra
Oost-Java
Oost-Kalimantan
Oost-Nusa Tenggara
Papoea
Riau
Riau-archipel
West-Java
West-Kalimantan
West-Nusa Tenggara
West-Papoea
West-Sulawesi
West-Sumatra
Yogyakarta
Zuid-Kalimantan
Zuid-Sulawesi
Zuid-Sumatra
Zuidoost-Sulawesi
Indonesie
Vlaggen