De Grote Prijs van Nederland in het Wereldkampioenschap MX3 in 2006 werd gehouden op Hemelvaartsdag, 25 mei 2006 in Rhenen, meer bepaald op het circuit Kwintelooijen nabij Veenendaal. Het was de eerste van twee Grote Prijzen op de kalender in Nederland van het Wereldkampioenschap MX3 2006.
Titelverdediger Sven Breugelmans, een zandspecialist, vond in Rhenen een circuit dat hem lag, en hij won beide reeksen vóór zijn teamgenoot en grote concurrent in het wereldkampioenschap, Yves Demaria. Daardoor kon Breugelmans de achterstand op Demaria in het wereldkampioenschap verder terugbrengen tot zeven puntjes. Breugelmans had ook in 2005 in Rhenen beide reeksen in de Grote Prijs gewonnen.
Uitslag eerste reeks
plaats naam land 1 Sven Breugelmans 2 Yves Demaria 3 Cristian Beggi 4 Jan Zaremba 5 Martin Zerava 6 Christian Stevanini 7 Michal Kadlecek 8 William Saris 9 Heikki van den Berg 10 Erik Davids
Uitslag tweede reeks
plaats naam land 1 Sven Breugelmans 2 Yves Demaria 3 Cristian Beggi 4 Jan Zaremba 5 Anne Advocaat 6 Michal Kadlecek 7 Jurgen Van Nooten 8 Michael Staufer 9 Christian Stevanini 10 Marc Ristori
Eindstand Grote Prijs
plaats naam land punten 1 Sven Breugelmans 50 2 Yves Demaria 44 3 Cristian Beggi 40 4 Jan Zaremba 36 5 Michal Kadlecek 29 6 Cristian Stevanini 27 7 William Saris 22 8 Marc Ristori 18 9 Jarno Verhorevoort 18 10 Martin Zerava 18
Tussenstand wereldkampioenschap
plaats naam land punten 1 Yves Demaria 255 2 Sven Breugelmans 248 3 Marc Ristori 197 4 Enrico Oddenino 184 5 Cristian Beggi 182 6 Saso Kragelj 125 7 Jan Zaremba 121 8 Daniele Bricca 107 9 Nenad Sipek 89 10 Michal Kadlecek 81 11 Vincent Collet 78 12 David Cadek 76 13 Martin Zerava 70 14 Michael Staufer 68 15 Christian Stevanini 61 16 Christophe Martin 56 17 Bader Manneh 53 18 Julien Vanni 35 19 Felice Compagnone 34 20 Jurgen Van Nooten 29
Categorie:MX3 in 2006