thumb|Johanna de Waanzinnige houdt het lijk van Filips de Schone bij zich na zijn dood
Het jaar 1506 is het 6e jaar in de 16e eeuw volgens de christelijke jaartelling.
Gebeurtenissen januari 10 - Filips de Schone reist af naar Castilië en laat het bestuur van de Nederlanden over aan Willem van Croy. 10 - De beroemde Laocoöngroep wordt teruggevonden bij het spitten van een wijngaard in Rome, vlak bij de Domus Aurea. 22 - Een groep van 150 Zwitserse huurlingen onder Kaspar von Silenen komt aan in Rome. Begin van de Zwitserse Garde.
februari 22 - Karel van Gelre maakt gebruik van het vertrek van Filips de Schone en verovert Wageningen. februari - Jobst I van Holstein-Schauenburg huwt Maria van Nassau-Siegen
maart 22 - Koning Ferdinand II van Aragon hertrouwt met Germaine van Foix.
april 18 - In aanwezigheid van Paus Julius II wordt de eerste steen gelegd voor de nieuwbouw van de Sint-Pietersbasiliek in Rome onder Bramante. 24 - In Termunten wordt een akkoord gesloten over de aanvaarding van graaf Edzard I van Oost-Friesland als heer van de stad Groningen.
mei 1 - Graaf Edzard I van Oost-Friesland trekt door de Poelepoort de stad Groningen binnen, waar hij wordt uitgeroepen tot "Heer van Groningen".
juni 27en 28 - Concordaat van Villafáfila: Ferdinand II van Aragon accepteert dat Filips de Schone het regentschap over Castilië voor Johanna de Waanzinnige krijgt.
september
13 - Giampaolo Baglioni, heerser van Perugia, geeft zich over aan de troepen van paus Julius II
oktober 7 - Paus Julius II geeft een bul uit waarin hij Giovanni II Bentivoglio excommuniceert en de stad Bologna onder interdict plaatst om zo de macht van de Kerkelijke Staat te herstellen.
november
10 - Paus Julius II en de pauselijke troepen bezetten met Franse steun Bologna.
zonder datum De Portugezen veroveren Socotra. De Universiteit van Urbino wordt gesticht. In Frankfurt (Oder) wordt de universiteit Alma mater Viadrina opgericht. Johannes Reuchlin publiceert Rudimenta linguae hebraicae. Juan Díaz de Solís en Vicente Yáñez Pinzón verkennen de kust van Nicaragua op zoek naar een doorvaart naar Indië. Tristão da Cunha ontdekt het eiland Tristan da Cunha. In de bul Cum tanto Divino probeert paus Julius II simonie en omkoping in de pausverkiezing tegen te gaan. Santiago de los Caballeros wordt verwoest door een aardbeving. paus Julius II keurt de regel van de Orde der Miniemen goed.
Beeldende kunst
Opvolging Castilië als regent voor Johanna - Johanna's echtgenoot Filips de Schone opgevolgd door haar vader Ferdinand II van Aragon Generalitat de Catalunya - Gonzalo Fernández de Heredia opgevolgd door Lluís Desplà i d'Oms Luik - Johan van Horne opgevolgd door Everhard van der Marck Nederlanden - Filips de Schone opgevolgd door zijn zoon Karel van Luxemburg onder regentschap van diens grootvader Maximiliaan I van Oostenrijk, waargenomen door diens dochter Margaretha van Oostenrijk als landvoogd Nevers en Eu - Engelbrecht opgevolgd door zijn zoon Karel II Polen en Litouwen - Alexander opgevolgd door zijn broer Sigismund I Ratibor - Nicolaas VII opgevolgd door Jan VI, op zijn beurt opgevolgd door Valentijn
Afbeeldingen
Geboren 15 februari - Juliana van Stolberg, Duits edelvrouw; moeder van Willem van Oranje (overleden 1580) februari - George Buchanan, Schots historicus en humanist 3 maart - Lodewijk van Beja, Portugees prins 7 april - Franciscus Xaverius, Spaans missionaris 13 april - Peter Faber, Frans theoloog 1 juli - Lodewijk II, koning van Hongarije en Bohemen (1516-1526) 4 oktober - Lê Chiêu Tông, kezier van Vietnam (1516-1526) oktober - Lodewijk van Blois, Zuid-Nederlands mysticus 4 december - Thomas Darcy, Engels hoveling Anayama Nobutomo, Japans samoerai Antonio d’Aragona, Italiaans edelman Nikolaus Federmann, Duits conquistador Jacob Hessels, Zuid-Nederlands jurist Johan I van Oost-Friesland, Duits edelman Sokollu Mehmet Paşa, Ottomaans generaal en staatsman William Paget, Engels staatsman Ruprecht van Palts-Veldenz, Duits edelman Jan van Renesse, Noord-Nederlands edelman Johannes Sleidanus, Luxemburgs diplomaat en historicus Cornelius Canis, Zuid-Nederlands componist (jaartal bij benadering) Karel van Croÿ, Zuid-Nederlands prelaat (jaartal bij benadering) Guilhelmus Lapidanus, Zuid-Nederlands humanist (jaartal bij benadering) Pierre Robert Olivétan, Frans humanist (jaartal bij benadering)
Overleden 11 februari - Girolamo Della Torre (~61), Italiaans medicus 19 februari - Helena van Württemberg, Duits edelvrouw 20 mei - Christoffel Columbus (55), Genuees ontdekkingsreiziger 6 juli - Pierre Anchemant (~46), Bourgondisch staatsman 26 juli - Anna van Foix-Candale (~22), echtgenote van Wladislaus II van Bohemen 15 augustus - Alexander Agricola (60), Zuid-Nederlands componist 19 augustus - Alexander (45), koning van Polen (1501-1506) en grootvorst van Litouwen (1492/1499-1506) 26 augustus - Sesshu Toyo (~86), Japans schilder 6 september - Richard Guildford, Engels vlootcommandant 13 september - Andrea Mantegna (~75), Italiaans schilder 25 september - Filips de Schone (27), vorst van de Bourgondische Nederlanden (1482-1506), koning-gemaal van Castilië (1504-1506) 30 september - Beatrix van Portugal (76), Portugees prinses 21 november - Engelbrecht van Nevers (44), Bourgondisch edelman 29 november - Jan de Bastaard van Nassau (~71), Zuid-Nederlands edelman Oswald I van den Bergh (~63), Noord-Nederlands edelman Andrea Bregno (~88), Lombardisch beeldhouwer Chödrag Gyatso (~52), Tibetaans geestelijk leider Albrecht van Palts-Mosbach (~58), Duits edelman Sancha van Aragon Johannes Lupi, Zuid-Nederlands componist (jaartal bij benadering)
Fictie De DLC "De verdwijning van Da Vinci" van Assassin's Creed: Brotherhood behandelt een (fictieve) kidnapping van Leonardo da Vinci in 1506.