Dit artikel bevat een lijst van vlaggen van Nederlandse waterschappen. Nederland is verdeeld in 21 waterschappen, waarvan sommige hoogheemraadschap worden genoemd. In deze lijst zijn alleen de waterschappen opgenomen die een eigen vlag voeren. De overige waterschappen gebruiken slechts een logovlag.
Door onder een vlag op 'Vlag van' te klikken, gaat u naar het artikel over de betreffende vlag. Door op de naam van het waterschap te klikken, gaat u naar het artikel over de betreffende waterschap. Zie voor voormalige waterschappen de Lijst van vlaggen van voormalige Nederlandse waterschappen.
Zie ook Lijst van wapens van Nederlandse waterschappen Lijst van Nederlandse waterschappen Lijst van vlaggen van Nederlandse deelgebieden Lijst van vlaggen van Nederlandse gemeenten
Nederland vlaggen