thumb|400px|De resultaten per kiesdistrict. De Algemene verkiezingen in Botswana van 1999 vonden op 16 oktober plaats.M. de Bruyne Grote Winkler Prins Jaarboek 2000. De Wereld in 1999, Elsevier bedrijfsinformatie, Kuwer, Uitgerij Het Spectrum, p. 101 Regeringspartij BDP wist haar aanhang te versterken (van 27 naar 33 zetels), maar met 57% van de stemmen is haar populariteit minder groot dan haar zetelaantal suggereert. De partij profiteerde echter van het districtenstelsel en het conflict binnen de oppositiepartij Botswana National Front (BNF), die in 1998 te maken kreeg met een partijsplitsing waaruit een nieuwe partij was voortgekomen, de Botswana Congress Party (BCP). Vanwege de ruzie viel het BNF terug van 13 naar 6 zetels, nieuwkomer BCP verwierf 1 zetel.African Election Database: Elections in Botswana. Gearchiveerd op 8 oktober 2021. De opkomst was 77,1% en daarmee iets hoger dan vijf jaar geleden.
Problemen met het registreren van kiezers Nadat de president, Festus Mogae, op 24 september 1999 in aanloop naar de verkiezingen de Nationale Vergadering had ontbonden, bleek dat 67.000 geregistreerde kiezers niet in het kiesregister waren opgenomen. Door tijdelijk de noodtoestand uit te roepen kon Mogae het parlement weer bijeen laten komen, zodat de Nationale Vergadering het inmiddels bijgewerkte register een officiële status kon geven.
Nationale Vergadering Het aantal kiesgerechtigden bedroeg 459.662, waarvan 354.466 (77,1%) hun stem uitbrachten. Naast de 44 verkozenen, werden nog 4 indirect gekozenen aan het parlement toegevoegd. Het aantal vrouwen bedroeg acht personen (waarvan twee indirecte gekozenen).Road to Botswana Parliament January 2017, uitgegeven door de Parliamentary Research Service, 2016, p. 22
PartijZetels%Botswana Democratic Party 33 57,15Botswana National Front 6 25,95Botswana Congress Party 1 11,90Botswana Alliance Movement 0 4,69MELS Movement Botswana 0 0,01Partijloos 0 0,30Totaal40100,00Geregistreerde kiezers/ opkomst 459.662 77,10Bron: AED
Regionale- en gemeenteraadsverkiezingen Bij de verkiezingen voor regionale volksvertegenwoordigingen en gemeenteraden die op dezelfde dag werden gehouden als de parlementsverkiezingen, bleef oppositiepartij Botswana National Front (BNF) alleen de grootste in de hoofdstad Gaborone, in andere steden en op het platteland werd de BDP de grootste.African Elections Database 1999 Local Elections in Botswana. Gearchiveerd op 23 april 2021.
Uitslag PartijZetelsBotswana Democratic Party 303Botswana National Front 80Botswana Congress Party 13Botswana Alliance Movement 9Totaal405Bron: AED
Presidentsverkiezingen Presidentskandidaten Op 18 september stelden de volgende personen zich kandidaat voor het presidentschap:
Ephraim L. Sethswaelo (BAM) Dr. Kenneth S. Koma (BNF) Michael K. Dingake (BCP) Festus G. Mogae (BDP)Road to Botswana Parliament January 2017, uitgegeven door de Parliamentary Research Service, 2016, pp. 20, 21
Uitslag Festus Mogae, die in 1998 Quett Masire was opgevolgd als staatshoofd werd op 20 oktober door Nationale Vergadering tot president gekozen voor de duur van vijf jaar.J. Ramsay, B. Morton, F. Morton: Historical Dictionary of Botswana, Scarecrow Press, Inc. Lanham Md., Londen 1996, p. 70 "ELECTIONS" thumb|left|250px|Festus Mogae werd door de Nationale Vergadering tot president gekozen.
Categorie:Verkiezingen in Botswana Botswana