De Jongere linie Anhalt-Zerbst (Duits: Jüngere Linie Anhalt-Zerbst) was een Duitse vorstelijke dynastie die regeerde over het kleine vorstendom Anhalt-Zerbst in Midden-Duitsland. In 1667 erfde de dynastie ook de Heerlijkheid Jever dat grensde aan Oost-Friesland. De bekendste vertegenwoordigster van de dynastie is Sophia Augusta Frederika, die in 1762 als Catharina II keizerin van Rusland werd.
De jongere linie Anhalt-Zerbst ontstond door de verdeling van het vorstendom Anhalt in 1603 onder de overlevende zonen van Joachim Ernst. Rudolf, Joachim Ernst's vierde zoon, kreeg de Anhaltse gebieden ten noorden van de Elbe met als hoofdstad Zerbst. Hij werd de stamvader van de linie Anhalt-Zerbst. Na de dood van Johan in 1667 ontstond de zijlinie Anhalt-Zerbst-Dornburg die gesticht werd door Johans jongere zoon Johan Lodewijk (I). De hoofdlinie bleef in Zerbst regeren tot 1742 toen Johan August kinderloos overleed. Hij werd opgevolgd door zijn neven Johan Lodewijk (II) en Christiaan August uit de zijlinie Anhalt-Zerbst-Dornburg. In 1793 overleed de laatste vorst van Zerbst, Frederik August, zonder kinderen na te laten. Hiermee stierf het Huis Anhalt-Zerbst in mannelijke lijn uit. De heerlijkheid Jever werd geërfd door keizerin Catharina II van Rusland. Anhalt-Zerbst zelf werd in 1796 verdeeld tussen Anhalt-Dessau, Anhalt-Bernburg en Anhalt-Köthen.
Stamboom
Rudolf (1576–1621)1 12px Dorothea Hedwig (1587–1609), dochter van Hendrik Julius van Brunswijk-Wolfenbüttel2 12px Magdalena (1585–1657), dochter van Johan VII van Oldenburg 1 Dorothea (1607–1634) 12px August van Brunswijk-Wolfenbüttel (1579–1666) 1 Eleonora (1608–1680) 12px Frederik van Sleeswijk-Holstein-Sonderburg-Norburg (1581–1658) 2 Elizabeth (1617–1639) 2 Johan (1621–1667) 12px Sophia Augusta (1630–1680), dochter van Frederik III van Sleeswijk-Holstein-Gottorp Karel Willem (1652–1718) 12px Sophia (1654-1724), dochter van August van Saksen-Weißenfels Johan August (1677–1742)1 12px Frederika (1675–1709), dochter van Frederik I van Saksen-Gotha-Altenburg2 12px Hedwig Frederika (1691–1752), dochter van Frederik Ferdinand van Württemberg-Weiltingen Magdalena Augusta (1679–1740) 12px Frederik II van Saksen-Gotha-Altenburg (1676–1732) Anton (1653-1714) 12px Auguste Antonie Marschall von Biberstein (1659–1736) Antoinette von Günthersfeld (1681–1754) Johan Adolf (1654-1726) Linie Anhalt-Zerbst-Dornburg: Johan Lodewijk (I) (1656–1704) 12px Christina Eleonora (1666-1699), dochter van Vollrath von Zeutsch Johan Lodewijk (II) (1688-1746) Christiaan August (1690-1747) 12px Johanna Elisabeth (1702-1760), dochter van Christiaan August van Holstein-Gottorp Sophia Augusta Frederika (Catharina II de Grote) (1729–1796), keizerin van Rusland (1762-1796) 12px Peter III van Rusland (1728-1762) Frederik August (1734-1793)1 12px Carolina (1732-1759), dochter van Maximiliaan van Hessen-Kassel2 12px Frederika (1744-1827), dochter van Victor Frederik van Anhalt-Bernburg Sophia Christina (1692–1747) Johan Frederik (1695-1742) 12px Cajetana von Sperling Sophia Augusta (1663-1694) 12px Johan Ernst III van Saksen-Weimar (1664-1707)